讲座开始啦--WinGX使用方法实例初解(一)本站原创转载必究

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大家好,让大家久等啦,讲座马上开始了,这次我们讲的是用XinGX解析晶体实例,先讲简单一点的,如果有需要我们在逐渐深入。有问题请在最后结束后回帖提问,以免中间打断,下面有请 gyhxxiaoxin 老师
本主题由 区长 wumingqiang 于 2010-8-6 13:06:51 执行 设置高亮 操作
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期待中!
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我先提个问题,就是在做合成时结晶时晶种的选择, 分析时仪器灵敏度的控制!
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老师给我们讲一下如何解谱吧 举几个例子,我感觉这个比较实用
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多年来,晶体学家们努力编写了大量的计算程序,用于晶体结构分析的各个方面,包括实验数据的还原与校正,空间群的确定,直接法和帕特森法等的结构解析方法,最小二乘法等结构精修,以及各种分子图形、结果的检查等功能。 下面简要列举几种常用的晶体结构分析程序的网址,以供大家阅读哦。 1.        SAPI HTTP://cryst.iphy.ac.cn 2.        CRYSTALS http:// www. Xtl.ox..ac.uk/crystals.html 3.        DIRDIF-99   http:// www-xtal.sci.kun.nl/documents/software/dirdif.html
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比如红外的溴化钾与药品的称样量的比例与仪器的灵敏度的关系,应该怎嘛去控制,如果有关系的话是仪器本身的问题 还是操作问题!
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WinGX使用方法实例初解(一)     由于Wingx可以用鼠标操作,省去了许多命令的繁琐,对于初学解晶体结构者来说,容易入门,本次主要介绍Wingx入门的基本操作。 一,        准备工作 1,        当你从衍射仪自带的解析程序中得到初结构,用Wingx 进行解析准备文件如下: 选取待解晶体中的6个文件,*****_om.hkl, *****_om.p4p,*.hkl,*.p4p,*.ins,*.lst,*.res, 本次实例中的6个文件如下图所示,根据实际情况不同,6个文件的名字会有所差异。复件是一个备份,防止解晶体一旦出现严重错误,可以从最初的备份重新开始。 2,启动XinGX, 把待解晶体导入进去。即 File-------JOB PATHS----Move Work Folder,如图所示: 即刻弹出一下对话框,如下图所示: 点击 Browse... ,弹出对话框 “Chang Work Folder and JobNme”,如下图所示, 找到你的待解晶体所在的位置,如下图: 选住 ins 文件,如P.ins 点击 打开。此时,对话框 “Chang Work Folder and JobNme”,如下图所示,点 OK 。 点击 OK 后,弹出下图 所示的 框框。
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点击 OK。这时候准备工作做完了,下一步开始解晶体。     (若要用Wingx 附带的其他程序包解析,下次讲解,请见谅。) 二,晶体中各个原子的确定。 1 点击如图所示的圆规状按钮, 弹出 SXGRAPH-SHELX Graphical Editor-P.res 交互界面,如下图所示,可以看到这个分子的结构,只是具体的原子需要我们去进一步确定。 2,原子的确定,鼠标左键单击我们要确定的原子,被选中的原子会被圈上黄色小球,如图所示: 在任一个选中的原子上 鼠标右击,弹出确定原子的对话框,如下图所示: 我们这里选中的原子都是碳原子,我们在 New names 里写上 C1 C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8 每一个原子的名字中间必须留一个空格。在Scattering factor type里选Cabon,如图所示。 点OK ,弹出下列对话框: 点Yes ,可以看到原来全是白色的结构变成了如下图所示: 同样的方法,把已知的原子都定义好,就如下图所示:
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